Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Limd1Q9QXD8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Limd1Q9QXD8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Limd1Q9QXD8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Limd1Q9QXD8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms