Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chaf1aQ9QWF0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chaf1aQ9QWF0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chaf1aQ9QWF0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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