Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms