Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col5a3Q9JLI2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Col5a3Q9JLI2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Col5a3Q9JLI2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms