Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmod4Q9JLH8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms