Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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