Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms