Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms