Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt112Q9DCG9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms