Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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