Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc97Q9DBT3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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