Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smg9Q9DB90 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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