Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ift43Q9DA69 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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