Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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