Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn22Q9D7U6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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