Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MsraQ9D6Y7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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