Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Zcchc13Q9D548 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms