Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Zc2hc1bQ9D534 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms