Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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