Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms