Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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