Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spns3Q9D232 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms