Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms