Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gins3Q9CY94 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms