Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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