Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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