Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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