Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pfdn1Q9CWM4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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