Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms