Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms