Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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