Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms