Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms