Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl3Q99N95 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl3Q99N95 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl3Q99N95 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl3Q99N95 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl3Q99N95 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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