Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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