Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ms4a6bQ99N09 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms