Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms