Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms