Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms