Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms