Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apobec3Q99J72 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Apobec3Q99J72 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apobec3Q99J72 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apobec3Q99J72 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Apobec3Q99J72 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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