Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms