Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms