Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms