Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms