Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms