Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms