Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms