Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms