Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssh3Q8K330 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssh3Q8K330 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssh3Q8K330 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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